手術前
依據每個人的熱量、營養需求，均衡攝取六大類飲食，以獲得完整的營養。若於治療前體重即已大幅流失或營養不良者，為了避免體重持續減輕、組織耗損或惡病質的發生，除了均衡攝取六大類食物外，則再強化比一般普通飲食含較多的熱量及蛋白質攝取。需執行腸胃道手術的病友，建議採取低渣飲食，可減少腸道中糞便的殘留量。
低渣飲食是減少食物經消化後在腸胃道留下殘渣(指不能消化的植物性纖維，動物的筋膠，牛奶等)的一種飲食。目的是為：減少經消化吸收後留於大腸內的殘渣、減少腸道的機械性刺激，使其獲得充分的休息、排除刺激品，減少腸道蠕動、幫助腸胃傷口早日癒合。一般性原則如下:
- 以均衡飲食為基礎。
- 食物應選擇嫩肉，精製的五榖類，過濾的果汁，蔬菜汁或煮熟的低纖維蔬菜（如：葉菜類），水果（如：瓜果類）。
- 避免刺激性及會產氣(引起脹氣)的食物：
- 乳品類：牛奶及奶製品應禁食。
- 肉類：可食去筋、皮之嫩肉、瘦肉，如：雞，鴨，魚，豬，牛肉
- 黃豆類：選擇加工精製的豆製品，如：豆漿，豆腐，豆花，豆干等。
- 蔬菜類：各種過濾果汁、嫩的葉菜類、去皮子的成熟瓜類
- 水果類：纖維含量少且去皮、去子的水果，如：木瓜、哈密瓜、西 瓜、葡萄、蘋果、香蕉、罐頭水果
- 全穀根莖類：精製的榖類及其製品，如白米飯，白麵條，土司。
- 油脂與堅果種子類：各種植物性油。忌硬殼果類，如:腰果，花生，核桃，杏仁等。
- 盡量採用可以使食物質軟的烹調方式(如肉類先裹上蛋汁或 太白粉後再烹調)避免油炸，油煎。
- 可適量的增加水分攝取，並養成定時排便的習慣，以防止便秘發生。
- 使用此種飲食應視情況補充礦物質及維生素。
- 此種飲食只是治療過程的一個階段，應視患者的情況，補充足夠的熱量及蛋白質，並漸次增加纖維的量，已達正常標準。
手術後
術後經醫師評估可恢復飲食者，建議採漸進式飲食，通常由清流質飲食→流質飲食→軟質或溫和飲食，約1-2週後即可恢復一般飲食。
- 清流質飲食為完全無渣，不導致產氣或刺激腸胃道蠕動，可提供水分、電解質及少許熱量，以幫助腸胃道恢復的一種飲食形式。米湯、過濾新鮮果汁、去油清湯、運動飲料及商業性清流質配方均為清流質飲食可選擇之食物。清流質飲食為過渡時期使用，不可長期使用。
- 流質飲食為含有均衡的營養素，不需咀嚼即可吞嚥，含有少量纖維質的飲食，如糊粥、麥糊、牛奶、豆漿、果汁、蔬菜汁、魚湯/肉湯、奶昔。
軟質/溫和飲食為營養均衡，質地柔軟且容易咀嚼、無刺激性、易消化、粗纖維含量低，不過硬、低油、低糖的飲食模式。如：稀飯或麵條、蒸蛋、豆腐、煮軟的肉類/魚肉、豆花、葉菜或瓜果蔬菜、軟質水果（蘋果泥、木瓜、葡萄、西瓜和水蜜桃等）、無刺激點心（布丁、果凍等）。